Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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