Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms