Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms