Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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