Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17078M0QW51 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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