Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms