Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms