Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms