Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3298E9PW80 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms