Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms