Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms