Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm2012B1B0R1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm2012B1B0R1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm2012B1B0R1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm2012B1B0R1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2012B1B0R1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms