Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NhsB1AV60 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NhsB1AV60 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms