Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Atp8b5A3FIN4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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