Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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