Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn1Q9Z0I7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms