Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcsQ9WU84 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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