Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms