Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hmgn5Q9JL35 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hmgn5Q9JL35 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hmgn5Q9JL35 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hmgn5Q9JL35 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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