Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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