Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl4Q9DCU6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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