Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ccdc97Q9DBT3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ccdc97Q9DBT3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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