Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms