Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tnfrsf13cQ9D8D0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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