Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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