Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms