Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms