Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Pramef12Q9D2F1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms