Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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