Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Exo5Q9CXP9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms