Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Xrcc3Q9CXE6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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