Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxxc1Q9CWW7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cxxc1Q9CWW7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cxxc1Q9CWW7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cxxc1Q9CWW7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cxxc1Q9CWW7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxxc1Q9CWW7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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