Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms