Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Chchd5Q9CQP3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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