Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nicn1Q9CQM0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nicn1Q9CQM0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nicn1Q9CQM0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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