Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Higd2aQ9CQJ1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms