Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms