Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms