Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sike1Q9CPR7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sike1Q9CPR7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms