Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprtQ99M80 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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PtprtQ99M80 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PtprtQ99M80 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PtprtQ99M80 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PtprtQ99M80 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms