Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hps3Q91VB4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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