Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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