Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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