Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms