Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup88Q8CEC0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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