Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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