Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac7Q8C2B3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac7Q8C2B3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac7Q8C2B3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac7Q8C2B3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hdac7Q8C2B3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdac7Q8C2B3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Hdac7Q8C2B3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac7Q8C2B3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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