Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms