Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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