Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NanogQ80Z64 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NanogQ80Z64 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NanogQ80Z64 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NanogQ80Z64 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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